Sabotin ist international wichtig aus der Sicht der Erhaltung von Vogelarten, deswegen hat er den Status eines Naturwertes, er wurde auch als ökologisch wichtiges Gebiet proklamiert. Er ist Teil des Europäischen Netzwerks von geschützten Gebieten Natura 2000.
Der für Sabotin typischste Vogel ist die Zippammer. Auf Sabotin wurde eines der häufigsten Aufkommen der Zippammer in Europa verzeichnet. Der Ziegenmelker (auch Nachtschwalbe genannt) hat am meisten dazu beigetragen dass Sabotin ein Schutzgebiet wurde. Ein interessanter Besucher des Sabotin ist der Gänsegeier, der hauptsächlich in den Sommermonaten dieses Gebiet auf seinem Weg zwischen der Insel Cres im Kroatien und den Alpen überfliegt.
Die Königin des Sabotinkammes und seiner Hänge ist eindeutig die Sandotter, sonst die häufigste Giftschlange Sloweniens. Am öftesten sieht man sie in der warmen Hälfte des Jahres, an stillen sonnigen Tagen aber kommt sie auch im Winter aus ihren Verstecken gekrochen.